
近日,上海交通大學醫(yī)學院附屬仁濟醫(yī)院檢驗科李敏教授與汪驊教授團隊在國際知名學術(shù)期刊《Military Medical Research》(中科院一區(qū),Top期刊,IF=22.9)發(fā)表題為《CRISPR-based assays for the detection of BK virus and JC virus infections post-kidney transplantation》的研究。該研究創(chuàng)新性地開發(fā)了一種名為ddCRISPR的雙靶標液滴定量檢測平臺,實現(xiàn)了對腎移植術(shù)后患者病毒載量的精準監(jiān)測;同時提出了一種基于試紙條的LFCRISPR檢測方法,為病毒的早期篩查及居家檢測提供了新思路。
腎移植術(shù)后,BK病毒(BKV)和JC病毒(JCV)感染是影響移植腎功能及威脅受者長期生活質(zhì)量的重要因素,因此對上述病毒進行早期檢測及術(shù)后監(jiān)測具有重要意義。然而,傳統(tǒng)檢測方法對實驗室條件、儀器設備及操作人員的專業(yè)水平要求較高,限制了其在基層醫(yī)療機構(gòu)的廣泛應用。研究團隊首先構(gòu)建了基于RPA-CRISPR/Cas13a的反應體系,實現(xiàn)了BKV和JCV的一鍋法檢測。進一步將該反應體系與雙通道液滴微流控芯片相結(jié)合,開發(fā)出一種新型雙靶標定量檢測方法(Dual-droplet microchip integrated with RPA-CRISPR, ddCRISPR)。實驗結(jié)果表明,該方法可分別檢測低至10拷貝/mL的BKV和1拷貝/mL的JCV,且兩種靶標之間具有良好的特異性及精準的定量檢測能力,初步滿足臨床檢測需求。
圖1 ddCRISPR檢測方法及性能驗證
2.ddCRISPR臨床應用性能評估為驗證ddCRISPR在臨床檢測中的實際應用效果,研究采用ddCRISPR與qPCR同步檢測125例來自腎移植患者及健康體檢者的血漿或尿液樣本。結(jié)果顯示,兩種檢測方法之間具有高度一致性與相關(guān)性。此外,研究還對一名接受腎移植手術(shù)的患者進行了為期半年的病毒載量動態(tài)監(jiān)測,并同步納入一項反映腎功能早期損傷的指標—尿白蛋白肌酐比(UACR)進行對比分析。結(jié)果表明,病毒載量變化趨勢與UACR變化趨勢基本一致,提示ddCRISPR不僅具備良好的定量檢測能力,還具有評估腎移植術(shù)后患者預后的潛力。
圖2. ddCRISPR用于實時監(jiān)測腎移植術(shù)后患者病毒載量
為助力腎移植術(shù)后患者病毒感染的早期篩查與居家檢測,本研究結(jié)合RPA-CRISPR/Cas13a一鍋法反應體系與測流層析試紙條技術(shù),開發(fā)了一種名為Lateral Flow Strip integrated with RPA-CRISPR(LFCRISPR)的檢測方法。實驗結(jié)果顯示,該方法可檢測低至100拷貝/μL的BKV或JCV。在臨床樣本檢測中,LFCRISPR與qPCR檢測結(jié)果具有高度一致性。此外,該方法能夠有效區(qū)分陽性與陰性樣本,便于實現(xiàn)快速、可視化的結(jié)果判讀。
圖3. LFCRISPR檢測方法的建立和臨床樣本驗證
本研究第一作者為上海交通大學醫(yī)學院附屬仁濟醫(yī)院檢驗科碩士研究生劉宇,共同第一作者為仁濟醫(yī)院檢驗科碩士研究生徐靖嵩;通訊作者為仁濟醫(yī)院檢驗科汪驊教授、李敏教授、劉倩教授以及上海市臨床公共衛(wèi)生中心李順教授。研究工作得到了國家自然科學基金和上海交通大學醫(yī)工交叉項目的資助。未來,研究團隊將進一步拓展該檢測平臺在其他移植相關(guān)病毒及多種生物標志物檢測中的應用,推動移植患者術(shù)后感染的精準檢測與早期防控,為提升病原體快速檢測能力提供有力支撐。
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