
近日,復(fù)旦大學(xué)附屬華山醫(yī)院神經(jīng)外科姚瑜教授課題組、病理科熊佶教授和可幫基因研發(fā)團(tuán)隊(duì)共同在《Acta Neurochirurgica》雜志上發(fā)表了題為“Development and validation of a 23-gene expression signature for molecular subtyping of medulloblastoma in a long-term Chinese cohort”的研究成果[1]。研究團(tuán)隊(duì)成功開發(fā)了基于基因表達(dá)譜的髓母細(xì)胞瘤分子分型檢測(cè)(Canhelp®-MB Assay),并在中國(guó)髓母細(xì)胞瘤人群隊(duì)列中首次驗(yàn)證其顯著臨床意義。研究結(jié)果證實(shí)Canhelp®-MB Assay可準(zhǔn)確判斷髓母細(xì)胞瘤的四種分子亞型,有望成為重要的輔助診斷工具,為改善髓母細(xì)胞瘤患者的治療和預(yù)后提供有力支持。
圖1. 文章截圖
研究背景
髓母細(xì)胞瘤(Medulloblastoma, MB)是兒童最常見(jiàn)的中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤,約占16~25%,每100萬(wàn)個(gè)人年發(fā)病約5例,男女比例約1.8:1[2]。WHO中樞神經(jīng)系統(tǒng)指南根據(jù)基因表達(dá)譜的不同將髓母細(xì)胞瘤分為WNT型,SHH型,Group 3型和Group 4型四種分子亞型[3]。四種分子亞型的流行病學(xué)、臨床表現(xiàn)和遺傳學(xué)特征各不相同,并且在治療和預(yù)后上具有顯著差別[4]。其中,WNT型腫瘤由于對(duì)放化療敏感性較高,患者的預(yù)后最好,五年生存率約為90%;Group 3型腫瘤惡性程度最高且極易轉(zhuǎn)移,在四種亞型中預(yù)后最差,五年生存率僅為50%。
目前髓母細(xì)胞瘤的治療主要以手術(shù)切除為主輔助放化療等綜合治療,但仍有部分患者的治療效果不佳,預(yù)后較差,并且過(guò)多的放化療容易對(duì)兒童造成嚴(yán)重的后遺癥。因此,明確髓母細(xì)胞瘤的分子亞型對(duì)于治療方案選擇和減少治療后遺癥至關(guān)重要,比如WNT型可通過(guò)減少術(shù)后放化療劑量,在有效治療疾病的基礎(chǔ)上降低相關(guān)并發(fā)癥的發(fā)生,從而改善患者的生活質(zhì)量;而Group 3型則需要增加劑量來(lái)進(jìn)一步降低復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)和改善預(yù)后。
目前臨床上常規(guī)采用免疫組化方法將髓母細(xì)胞瘤分為WNT型、SHH型和非WNT/SHH型,但由于主觀性差異和低靈敏度,無(wú)法對(duì)4種分子亞型進(jìn)行精準(zhǔn)識(shí)別。尤其是免疫組化方法無(wú)法進(jìn)一步區(qū)分Group 3和Group 4兩種亞型。
髓母細(xì)胞瘤分子分型檢測(cè)(Canhelp®-MB Assay)
研究團(tuán)隊(duì)基于基因表達(dá)譜開發(fā)了一種髓母細(xì)胞瘤分子分型的人工智能模型,并采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR平臺(tái)建立了多基因檢測(cè)方法(Canhelp®-MB Assay)。通過(guò)檢測(cè)福爾馬林石蠟包埋組織樣本中23個(gè)分子亞型相關(guān)特征基因的表達(dá)模式,并與參考數(shù)據(jù)庫(kù)中髓母細(xì)胞瘤各分子亞型的基因表達(dá)模式進(jìn)行比較,客觀判斷髓母細(xì)胞瘤的四種分子亞型(圖2)。Canhelp®-MB Assay已獲得中、美兩國(guó)發(fā)明專利授權(quán);相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表于美國(guó)臨床腫瘤學(xué)術(shù)年會(huì)(ASCO)和歐洲腫瘤內(nèi)科學(xué)術(shù)年會(huì)(ESMO)等高水平國(guó)際學(xué)術(shù)會(huì)議。
圖2. Canhelp®-MB Assay檢測(cè)流程
研究收集了復(fù)旦大學(xué)附屬華山醫(yī)院共142例髓母細(xì)胞瘤患者的福爾馬林石蠟包埋組織樣本,采用Canhelp®-MB Assay進(jìn)行基因表達(dá)譜檢測(cè)并判斷分子亞型。檢測(cè)結(jié)果為WNT型(21例,15%),SHH型(41例,29%),Group 3型(16例,11%)和Group 4型(64例,45%)。同時(shí),研究人員收集28例臨床樣本,采用Canhelp®-MB Assay與美國(guó)同類產(chǎn)品NanoString nCounter Assay進(jìn)行頭對(duì)頭比較,兩種檢測(cè)方法的一致性達(dá)到96.4%(27/28)。
進(jìn)一步地,研究人員基于長(zhǎng)期隨訪數(shù)據(jù)(中位隨訪時(shí)間為34.1個(gè)月),深入分析患者的預(yù)后特征發(fā)現(xiàn)四種分子亞型的總生存期和無(wú)進(jìn)展生存期存在顯著差異(p < 0.0001)。其中,四種分子亞型的5年總生存期分別為80%(WNT型),62%(SHH型),27%(Group 3型)和47%(Group 4型)(圖3a),5年無(wú)進(jìn)展生存期分別為80%(WNT型),52%(SHH型),27%(Group 3型)和45%(Group 4型)(圖3b)。不同分子亞型的臨床預(yù)后特征與國(guó)內(nèi)外相關(guān)研究報(bào)道高度一致。
圖3. 四種分子亞型的生存曲線圖(a)總生存期(b)無(wú)進(jìn)展生存期
Canhelp®-MB Assay作為國(guó)內(nèi)首款髓母細(xì)胞瘤基因表達(dá)譜檢測(cè)產(chǎn)品,已成功應(yīng)用于臨床。通過(guò)中國(guó)患者的大樣本量臨床驗(yàn)證,證實(shí)Canhelp®-MB Assay在髓母細(xì)胞瘤分子分型中具有優(yōu)異的分析性能。該檢測(cè)方法有助于臨床醫(yī)生對(duì)髓母細(xì)胞瘤患者進(jìn)行精準(zhǔn)的預(yù)后評(píng)估,并為制定個(gè)性化的治療方案提供重要支持,從而改善患者的預(yù)后。此外,Canhelp®-MB Assay采用了常規(guī)的實(shí)時(shí)熒光定量PCR平臺(tái),并且兼容病理科常用的福爾馬林石蠟包埋組織,展現(xiàn)出了其在臨床應(yīng)用中的可靠性和可及性,有望成為臨床上的重要輔助診斷工具。
參考文獻(xiàn)
1. Wang Y, Huang J, Yin X, et al. Development and validation of a 23-gene expression signature for molecular subtyping of medulloblastoma in a long-term Chinese cohort. Acta Neurochir (Wien). 2024 Feb 8; 166(1):72.
2. Northcott PA, Robinson GW, Kratz CP, et al. Medulloblastoma. Nat Rev Dis Primers. 2019 Feb 14; 5(1):11.
3. Louis DN, Perry A, Reifenberger G, et al. The 2016 World Health Organization Classification of Tumors of the Central Nervous System: a summary. Acta Neuropathol. 2016 Jun; 131(6):803-20.
4. Kumar V, Kumar V, McGuire T, et al. Challenges and Recent Advances in Medulloblastoma Therapy. Trends Pharmacol Sci. 2017 Dec; 38(12):1061-1084.
來(lái)源:可幫基因
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