
"精準醫(yī)學(xué)背景下,NGS已發(fā)展成為癌癥精準診療的核心技術(shù),為癌癥患者,特別是晚期癌癥患者開辟了一個精準診療新框架。那么,基于NGS的診療是否真的帶來了臨床獲益?特別是延長癌癥進展的時間(PFS)和/或增加總生存期(OS)。
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隨著科技的進度,癌癥治療領(lǐng)域迎來了前所未有的發(fā)展機遇;贜GS(二代測序)的基因檢測技術(shù)革新了臨床癌癥精準診療路徑,并迅速成為晚期癌癥患者的管理標準之一。
NGS與癌癥靶向治療之間的關(guān)系密切。2020年,通過NGS識別的28種靶向療法獲得了FDA的批準,1 并且越來越多的臨床試驗使用NGS來確定患者的入組資格。2 美國臨床腫瘤學(xué)會(ASCO)近期發(fā)布了一份臨時臨床意見(2022),概述了針對轉(zhuǎn)移性或晚期癌癥患者進行基因檢測的建議,包括推薦NGS多基因panel檢測,以識別靶向藥物的靶標情況。3 雖然先前許多研究已經(jīng)證明在特定環(huán)境下NGS檢測的臨床價值和經(jīng)濟價值。但截至目前,尚未有綜合性研究總結(jié)在多種腫瘤類型患者中接受NGS-informed(NGS知情)靶向治療的PFS和OS情況。
2023年6月7日,《臨床腫瘤學(xué)雜志·精準腫瘤學(xué)》(JCO Precis Oncol)發(fā)表了一篇綜述,全面回顧了NGS對晚期癌癥患者的治療臨床效用:研究者通過比較在NGS檢測基礎(chǔ)上接受靶向治療的患者與未接受靶向治療的患者的無進展生存期(PFS)和/或總生存期(OS),結(jié)果發(fā)現(xiàn)NGS知情靶向治療的癌癥患者的PFS和OS顯著延長。4
▲全面回顧NGS對晚期癌癥患者治療的臨床效用
方法
研究者在2021年8月6日利用PubMed檢索了5年內(nèi)(2016年8月7日-2021年8月6日)發(fā)表的有關(guān)“利用NGS檢測晚期(III期或IV期)、轉(zhuǎn)移性、難治性或復(fù)發(fā)性成人癌癥患者PFS和OS”的英文期刊出版物 5,854篇;并且還于2021年11月29日利用Embase檢索了2020年和2021年在ASCO、ESMO和WCLC會議上發(fā)表的會議摘要 621篇,合計 6,475篇。
研究者提取了以下內(nèi)容進行分析:研究設(shè)計、研究群體、NGS檢測前接受的治療路線、臨床試驗登記、接受NGS檢測和靶向治療的患者人數(shù)、OS、PFS、腫瘤反應(yīng)、接受的NGS檢測類型和NGS檢測特征(如檢測的基因數(shù)量和來源類型,組織/血液,DNA/RNA)。統(tǒng)計學(xué)意義定義為 P<0.05。
經(jīng)過兩個篩選階段和數(shù)據(jù)提取,29篇期刊出版物和2篇不重疊的會議摘要(合計31篇)符合標準并被納入分析:21篇(68%)采用回顧性觀察隊列設(shè)計、5篇(16%)采用前瞻性觀察隊列設(shè)計、5篇(16%)采用非隨機臨床試驗。
▲ 31篇文章納入綜述分析
結(jié)果
(1)存活率結(jié)果
接受NGS檢測的患者中,平均29%有針對性的靶向療法(匹配療法或臨床試驗)。未接受靶向療法的原因有多種,包括沒有可用的靶向治療(沒有可操作基因突變等),醫(yī)生選擇替代治療,患者進展或死亡,患者拒絕治療,或患者失去隨訪等。
31項研究評估了接受NGS知情靶向治療的癌癥患者亞組的PFS和OS。在不同腫瘤類型的11篇和16篇期刊出版物中,那些接受NGS知情靶向治療患者的PFS和OS顯著延長。
▲ 接受/未接受NGS知情靶向治療患者PFS和OS情況
(2)NGS檢測特征
38%的患者僅做了1次檢測,62%的患者做了1次以上檢測。NGS檢測panel,最小基因數(shù)為11基因,最大基因數(shù)為596基因。檢測樣本類型為組織和/或血液(體液),核酸類型為DNA或DNA+RNA。
結(jié)論
綜合而言,用NGS檢測來確定匹配的靶向療法會對癌癥患者的PFS和OS產(chǎn)生影響。半數(shù)以上的期刊出版物報告說,接受NGS知情靶向治療的患者PFS和OS顯著延長。
延伸:NGS對晚期腫瘤患者作用
2021年2月25日,《JAMA Oncology》在線發(fā)表了NGS在晚期實體腫瘤中的臨床價值評估。5 該研究使用NGS對1,000余名晚期或轉(zhuǎn)移性癌癥患者的DNA(WES和1,700基因靶向panel)和RNA(腫瘤轉(zhuǎn)錄組)進行了測序檢測,并評估治療反應(yīng)和臨床獲益情況。
結(jié)果顯示:
1)在80.5%的患者中發(fā)現(xiàn)了潛在的可操作的基因組變異;
2)在接受NGS知情靶向治療患者中,37.1%患者取得了臨床獲益,19.7%的患者獲得了超級應(yīng)答(疾病控制至少一年);
3)對于原發(fā)灶不明癌患者,在50.9%的病例中,NGS解決了組織溯源問題,為醫(yī)生提供更好的線索,了解哪些標準療法和靶向療法可能會有所幫助;
4)在15.8%的癌癥患者中發(fā)現(xiàn)了潛在的可遺傳胚系致病變異(增加患癌風(fēng)險),其中4.8%與靶向治療相關(guān)。
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NGS對晚期癌癥患者的用處有多大?
參考資料:
1.U.S. Food and Drug Administration: Novel drug approvals for 2020. FDA, 2022. https://www.fda.gov/drugs/new-drugs-fda-cders-new-molecular-entities-andnew-therapeutic-biological-products/novel-drug-approvals-2020
2.Siu LL, Conley BA, Boerner S, et al: Next-generation sequencing to guide clinical trials. Clin Cancer Res 21:4536-4544, 2015
3.Chakravarty D, Johnson A, Sklar J, et al: Somatic genomic testing in patients with metastatic or advanced cancer: ASCO provisional clinical opinion. J Clin Oncol 40:1231-1258, 2022
4.Gibbs SN, Peneva D, Cuyun Carter G, Palomares MR, Thakkar S, Hall DW, Dalglish H, Campos C, Yermilov I. Comprehensive Review on the Clinical Impact of Next-Generation Sequencing Tests for the Management of Advanced Cancer. JCO Precis Oncol. 2023 Jun;7:e2200715.
5.Cobain EF, Wu Y, Vats P, et al. Assessment of Clinical Benefit of Integrative Genomic Profiling in Advanced Solid Tumors. JAMA Oncol. 2021;7(4):525–533.
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